E rua nga waahanga matua o te punaha electrophoresis: he Power Supply me te Electrophoresis Chamber. Ko te hiko e tuku hiko. Ko te "mana," i tenei keehi, ko te hiko. Ko te hiko ka puta mai i te hiko hiko ka rere, i tetahi huarahi, mai i tetahi pito o te ruma electrophoresis ki tetahi atu. Ko te cathode me te anode o te ruuma te mea e kukume ana i nga matūriki kua whakaekea.
Kei roto i te ruuma electrophoresis, he paepae--atu, he paepae whakarewa. Kei roto i te paepae whakarewa nga waahanga e whai ake nei: pereti karaihe ka uru ki raro o te paepae whakarewa. Ka mau te gel i roto i te paepae whakarewa. He rite te ahua o te "heru" ki tona ingoa. Ka tuuhia te heru ki roto i nga mokowhiti ki te taha o te paepae whakarewa. I muri i te pakari o te ra, ka tangohia te heru. Ko nga "niho" o te heru ka waiho he rua iti i roto i te kiri e kiia nei he "puna." Ka mahia nga puna ina ka whakamaroke te kiri wera, ka rewa ki nga niho o te heru. Ka toia te heru i muri i te whakamatao o te ra, ka waiho he puna. Ko nga puna he waahi hei whakatakoto i nga matūriki e hiahia ana koe ki te whakamatautau. Me tino tupato te tangata kia kaua e whakaporearea i te ra i te wa e utaina ana nga matūriki. Ko te pakaru, te pakaru ranei i te reera ka pa ki o hua.